Решение задач, возложенных на заповедник и подведомственные заказники, осуществляют следующие структурные подразделения:
- Отдел охраны заповедной территории и федеральных заказников
- Научный отдел
- Отдел экологического просвещения
- Отдел обеспечения основной деятельности
- Отдел бухгалтерского учета и отчетности
- Кадрово-правовой отдел
Отдел охраны заповедной территории и федеральных заказников
Основная задача отдела — обеспечение соблюдения режима особой охраны на участках заповедника, в их охранных зонах и в трех федеральных заказниках – Аграханском, Самурском и Тляратинском, расположенных на территории Республики Дагестан.
В состав отдела входят государственные инспекторы, старшие государственные инспекторы двух заповедных участков, старшие государственные инспекторы трех заказников и начальник отдела – заместитель директора по охране.
Для поддержки работы отдела и контроля выполнения, возложенных на сотрудников задач создана оперативная группа по охране заповедной территории, которая подчиняется напрямую директору заповедника.
Научный отдел
Ключевые задачи научного отдела — это регулярные наблюдения за состоянием охраняемых природных территорий и объектов, исследование процессов и явлений в экосистемах, ведение Летописи природы и публикация Трудов заповедника.
В состав отдела водят лаборанты, научные сотрудники и руководитель отдела – заместитель директора по научной работе.
Отдел экологического просвещения
Экологическое просвещение – одно из важнейших направлений работы заповедника. В состав отдела входят экскурсоводы, специалисты и начальник отдела – заместитель директора по экологическому просвещению. Основные задачи отдела – экологическое просвещение всех слоев населения, распространение знаний о заповеднике, его природном наследии и природоохранной деятельности, организация образовательных и пропагандистских мероприятий и акций.
Отдел обеспечения основной деятельности
Основную деятельность заповедника обеспечивают хозяйственные работники, мастера, водители и административный персонал, которыми руководит начальник отдела. Главная задача отдела – полное материально-техническое обеспечение деятельности всех структурных подразделений заповедника.
Отдел бухгалтерского учета и отчетности
Финансово-экономическая деятельность и отчетность заповедника обеспечивают работники этого отдела, которым руководит главный бухгалтер заповедника.
Кадрово-правовой отдел
Основные задачи отдела – работа с кадрами и правовое обеспечение деятельности всех отделов заповедника.